Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtnd1P03888 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mtnd1P03888 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mtnd1P03888 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mtnd1P03888 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mtnd1P03888 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mtnd1P03888 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mtnd1P03888 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mtnd1P03888 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mtnd1P03888 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mtnd1P03888 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mtnd1P03888 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mtnd1P03888 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mtnd1P03888 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtnd1P03888 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtnd1P03888 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtnd1P03888 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mtnd1P03888 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtnd1P03888 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtnd1P03888 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtnd1P03888 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtnd1P03888 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtnd1P03888 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtnd1P03888 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtnd1P03888 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnd1P03888 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtnd1P03888 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtnd1P03888 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtnd1P03888 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtnd1P03888 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtnd1P03888 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtnd1P03888 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtnd1P03888 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtnd1P03888 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtnd1P03888 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtnd1P03888 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnd1P03888 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnd1P03888 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnd1P03888 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd1P03888 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtnd1P03888 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtnd1P03888 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtnd1P03888 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtnd1P03888 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtnd1P03888 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtnd1P03888 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtnd1P03888 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtnd1P03888 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtnd1P03888 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtnd1P03888 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mtnd1P03888 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mtnd1P03888 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mtnd1P03888 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mtnd1P03888 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mtnd1P03888 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mtnd1P03888 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mtnd1P03888 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mtnd1P03888 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mtnd1P03888 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mtnd1P03888 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms