Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AfpP02772 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AfpP02772 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AfpP02772 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AfpP02772 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AfpP02772 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AfpP02772 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AfpP02772 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AfpP02772 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AfpP02772 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AfpP02772 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AfpP02772 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AfpP02772 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AfpP02772 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AfpP02772 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AfpP02772 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AfpP02772 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AfpP02772 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AfpP02772 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AfpP02772 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AfpP02772 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AfpP02772 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AfpP02772 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AfpP02772 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AfpP02772 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AfpP02772 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AfpP02772 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AfpP02772 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AfpP02772 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AfpP02772 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AfpP02772 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AfpP02772 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AfpP02772 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AfpP02772 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AfpP02772 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AfpP02772 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AfpP02772 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AfpP02772 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AfpP02772 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AfpP02772 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AfpP02772 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AfpP02772 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AfpP02772 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AfpP02772 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AfpP02772 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AfpP02772 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
AfpP02772 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AfpP02772 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AfpP02772 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AfpP02772 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AfpP02772 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AfpP02772 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AfpP02772 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AfpP02772 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AfpP02772 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AfpP02772 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AfpP02772 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AfpP02772 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AfpP02772 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AfpP02772 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AfpP02772 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AfpP02772 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AfpP02772 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AfpP02772 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AfpP02772 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AfpP02772 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AfpP02772 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AfpP02772 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AfpP02772 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AfpP02772 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AfpP02772 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AfpP02772 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AfpP02772 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AfpP02772 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AfpP02772 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AfpP02772 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AfpP02772 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AfpP02772 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AfpP02772 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AfpP02772 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AfpP02772 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AfpP02772 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AfpP02772 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AfpP02772 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AfpP02772 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AfpP02772 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AfpP02772 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AfpP02772 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AfpP02772 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AfpP02772 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
AfpP02772 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AfpP02772 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AfpP02772 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.54■■■□□ 2
AfpP02772 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AfpP02772 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AfpP02772 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AfpP02772 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AfpP02772 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AfpP02772 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AfpP02772 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms