Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casp8O89110 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casp8O89110 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casp8O89110 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casp8O89110 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Casp8O89110 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casp8O89110 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casp8O89110 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Casp8O89110 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casp8O89110 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casp8O89110 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Casp8O89110 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casp8O89110 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casp8O89110 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casp8O89110 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casp8O89110 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Casp8O89110 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Casp8O89110 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casp8O89110 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Casp8O89110 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp8O89110 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp8O89110 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp8O89110 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casp8O89110 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Casp8O89110 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casp8O89110 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casp8O89110 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp8O89110 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casp8O89110 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp8O89110 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp8O89110 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp8O89110 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casp8O89110 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Casp8O89110 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casp8O89110 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casp8O89110 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casp8O89110 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Casp8O89110 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casp8O89110 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casp8O89110 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casp8O89110 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp8O89110 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casp8O89110 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casp8O89110 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp8O89110 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casp8O89110 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casp8O89110 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casp8O89110 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casp8O89110 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Casp8O89110 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp8O89110 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp8O89110 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Casp8O89110 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Casp8O89110 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Casp8O89110 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Casp8O89110 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Casp8O89110 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Casp8O89110 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Casp8O89110 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casp8O89110 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Casp8O89110 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casp8O89110 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casp8O89110 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casp8O89110 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp8O89110 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp8O89110 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp8O89110 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp8O89110 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp8O89110 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp8O89110 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp8O89110 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casp8O89110 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp8O89110 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp8O89110 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp8O89110 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp8O89110 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp8O89110 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp8O89110 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp8O89110 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp8O89110 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp8O89110 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms