Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcnkO88874 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcnkO88874 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CcnkO88874 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CcnkO88874 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcnkO88874 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CcnkO88874 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CcnkO88874 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcnkO88874 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcnkO88874 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CcnkO88874 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcnkO88874 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcnkO88874 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CcnkO88874 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcnkO88874 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CcnkO88874 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CcnkO88874 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcnkO88874 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcnkO88874 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcnkO88874 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnkO88874 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnkO88874 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnkO88874 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnkO88874 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnkO88874 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnkO88874 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnkO88874 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnkO88874 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnkO88874 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnkO88874 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnkO88874 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnkO88874 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnkO88874 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnkO88874 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcnkO88874 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcnkO88874 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcnkO88874 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnkO88874 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcnkO88874 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcnkO88874 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcnkO88874 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcnkO88874 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcnkO88874 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcnkO88874 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnkO88874 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnkO88874 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnkO88874 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnkO88874 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnkO88874 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnkO88874 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcnkO88874 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnkO88874 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnkO88874 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnkO88874 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnkO88874 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnkO88874 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnkO88874 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnkO88874 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnkO88874 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnkO88874 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnkO88874 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnkO88874 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnkO88874 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CcnkO88874 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnkO88874 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnkO88874 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnkO88874 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnkO88874 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnkO88874 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnkO88874 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms