Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng2O88602 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng2O88602 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacng2O88602 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng2O88602 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacng2O88602 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacng2O88602 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacng2O88602 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng2O88602 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng2O88602 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng2O88602 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng2O88602 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng2O88602 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacng2O88602 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacng2O88602 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacng2O88602 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng2O88602 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacng2O88602 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacng2O88602 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacng2O88602 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacng2O88602 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacng2O88602 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacng2O88602 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacng2O88602 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacng2O88602 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacng2O88602 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacng2O88602 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacng2O88602 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacng2O88602 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacng2O88602 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacng2O88602 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacng2O88602 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacng2O88602 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacng2O88602 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng2O88602 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacng2O88602 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacng2O88602 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacng2O88602 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng2O88602 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacng2O88602 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacng2O88602 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacng2O88602 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng2O88602 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng2O88602 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacng2O88602 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacng2O88602 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacng2O88602 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacng2O88602 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacng2O88602 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacng2O88602 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacng2O88602 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng2O88602 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng2O88602 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng2O88602 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng2O88602 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacng2O88602 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng2O88602 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng2O88602 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng2O88602 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacng2O88602 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng2O88602 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng2O88602 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng2O88602 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng2O88602 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms