Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dnmt3bO88509 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dnmt3bO88509 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dnmt3bO88509 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dnmt3bO88509 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dnmt3bO88509 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt3bO88509 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dnmt3bO88509 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dnmt3bO88509 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dnmt3bO88509 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dnmt3bO88509 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnmt3bO88509 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dnmt3bO88509 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dnmt3bO88509 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dnmt3bO88509 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnmt3bO88509 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnmt3bO88509 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnmt3bO88509 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnmt3bO88509 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Dnmt3bO88509 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnmt3bO88509 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnmt3bO88509 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dnmt3bO88509 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt3bO88509 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt3bO88509 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt3bO88509 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt3bO88509 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt3bO88509 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt3bO88509 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt3bO88509 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Dnmt3bO88509 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt3bO88509 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnmt3bO88509 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dnmt3bO88509 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnmt3bO88509 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dnmt3bO88509 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dnmt3bO88509 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dnmt3bO88509 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt3bO88509 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dnmt3bO88509 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dnmt3bO88509 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt3bO88509 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dnmt3bO88509 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnmt3bO88509 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dnmt3bO88509 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dnmt3bO88509 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnmt3bO88509 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnmt3bO88509 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnmt3bO88509 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnmt3bO88509 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnmt3bO88509 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnmt3bO88509 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnmt3bO88509 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnmt3bO88509 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnmt3bO88509 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnmt3bO88509 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt3bO88509 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnmt3bO88509 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt3bO88509 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnmt3bO88509 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnmt3bO88509 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt3bO88509 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt3bO88509 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnmt3bO88509 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnmt3bO88509 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnmt3bO88509 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnmt3bO88509 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnmt3bO88509 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms