Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pole2O54956 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pole2O54956 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pole2O54956 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pole2O54956 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pole2O54956 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pole2O54956 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pole2O54956 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pole2O54956 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pole2O54956 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pole2O54956 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pole2O54956 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pole2O54956 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pole2O54956 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pole2O54956 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pole2O54956 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pole2O54956 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pole2O54956 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pole2O54956 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pole2O54956 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pole2O54956 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pole2O54956 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pole2O54956 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pole2O54956 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pole2O54956 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pole2O54956 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pole2O54956 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pole2O54956 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pole2O54956 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pole2O54956 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pole2O54956 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pole2O54956 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pole2O54956 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pole2O54956 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pole2O54956 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pole2O54956 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pole2O54956 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pole2O54956 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pole2O54956 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pole2O54956 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pole2O54956 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pole2O54956 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pole2O54956 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pole2O54956 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pole2O54956 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pole2O54956 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pole2O54956 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pole2O54956 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pole2O54956 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pole2O54956 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pole2O54956 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pole2O54956 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pole2O54956 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pole2O54956 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pole2O54956 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pole2O54956 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pole2O54956 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pole2O54956 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pole2O54956 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pole2O54956 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pole2O54956 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pole2O54956 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pole2O54956 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pole2O54956 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pole2O54956 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pole2O54956 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pole2O54956 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pole2O54956 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pole2O54956 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pole2O54956 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pole2O54956 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pole2O54956 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pole2O54956 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pole2O54956 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.5 ms