Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clcn6O35454 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clcn6O35454 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clcn6O35454 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clcn6O35454 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clcn6O35454 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clcn6O35454 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clcn6O35454 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clcn6O35454 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clcn6O35454 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clcn6O35454 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clcn6O35454 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clcn6O35454 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clcn6O35454 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clcn6O35454 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clcn6O35454 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clcn6O35454 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clcn6O35454 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clcn6O35454 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clcn6O35454 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn6O35454 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn6O35454 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clcn6O35454 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Clcn6O35454 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn6O35454 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn6O35454 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clcn6O35454 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clcn6O35454 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn6O35454 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn6O35454 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clcn6O35454 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clcn6O35454 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clcn6O35454 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Clcn6O35454 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Clcn6O35454 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clcn6O35454 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clcn6O35454 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clcn6O35454 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clcn6O35454 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Clcn6O35454 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clcn6O35454 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clcn6O35454 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clcn6O35454 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Clcn6O35454 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clcn6O35454 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clcn6O35454 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clcn6O35454 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clcn6O35454 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clcn6O35454 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clcn6O35454 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clcn6O35454 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clcn6O35454 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clcn6O35454 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clcn6O35454 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clcn6O35454 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Clcn6O35454 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn6O35454 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn6O35454 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clcn6O35454 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clcn6O35454 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clcn6O35454 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clcn6O35454 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clcn6O35454 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clcn6O35454 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clcn6O35454 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clcn6O35454 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clcn6O35454 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clcn6O35454 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clcn6O35454 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clcn6O35454 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clcn6O35454 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clcn6O35454 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clcn6O35454 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clcn6O35454 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clcn6O35454 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clcn6O35454 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clcn6O35454 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms