Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Casq1O09165 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Casq1O09165 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Casq1O09165 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Casq1O09165 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Casq1O09165 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Casq1O09165 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Casq1O09165 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Casq1O09165 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Casq1O09165 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Casq1O09165 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Casq1O09165 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Casq1O09165 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Casq1O09165 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Casq1O09165 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Casq1O09165 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Casq1O09165 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Casq1O09165 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Casq1O09165 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Casq1O09165 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Casq1O09165 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Casq1O09165 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Casq1O09165 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Casq1O09165 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Casq1O09165 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Casq1O09165 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Casq1O09165 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Casq1O09165 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Casq1O09165 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Casq1O09165 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Casq1O09165 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Casq1O09165 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Casq1O09165 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Casq1O09165 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Casq1O09165 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Casq1O09165 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Casq1O09165 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Casq1O09165 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Casq1O09165 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Casq1O09165 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Casq1O09165 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Casq1O09165 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Casq1O09165 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Casq1O09165 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Casq1O09165 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Casq1O09165 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Casq1O09165 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Casq1O09165 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Casq1O09165 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Casq1O09165 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Casq1O09165 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Casq1O09165 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Casq1O09165 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Casq1O09165 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Casq1O09165 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Casq1O09165 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Casq1O09165 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Casq1O09165 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Casq1O09165 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Casq1O09165 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Casq1O09165 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Casq1O09165 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Casq1O09165 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Casq1O09165 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Casq1O09165 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Casq1O09165 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Casq1O09165 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Casq1O09165 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Casq1O09165 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Casq1O09165 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Casq1O09165 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Casq1O09165 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Casq1O09165 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Casq1O09165 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Casq1O09165 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Casq1O09165 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Casq1O09165 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Casq1O09165 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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