Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AlyrefO08583 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AlyrefO08583 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AlyrefO08583 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AlyrefO08583 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AlyrefO08583 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlyrefO08583 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlyrefO08583 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlyrefO08583 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlyrefO08583 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AlyrefO08583 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlyrefO08583 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlyrefO08583 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlyrefO08583 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlyrefO08583 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlyrefO08583 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AlyrefO08583 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AlyrefO08583 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlyrefO08583 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AlyrefO08583 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AlyrefO08583 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlyrefO08583 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlyrefO08583 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AlyrefO08583 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AlyrefO08583 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AlyrefO08583 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AlyrefO08583 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AlyrefO08583 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlyrefO08583 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlyrefO08583 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AlyrefO08583 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AlyrefO08583 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AlyrefO08583 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AlyrefO08583 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AlyrefO08583 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AlyrefO08583 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AlyrefO08583 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AlyrefO08583 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AlyrefO08583 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlyrefO08583 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AlyrefO08583 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlyrefO08583 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AlyrefO08583 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlyrefO08583 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
AlyrefO08583 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AlyrefO08583 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AlyrefO08583 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
AlyrefO08583 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AlyrefO08583 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AlyrefO08583 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AlyrefO08583 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AlyrefO08583 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AlyrefO08583 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlyrefO08583 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AlyrefO08583 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AlyrefO08583 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlyrefO08583 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AlyrefO08583 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AlyrefO08583 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AlyrefO08583 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AlyrefO08583 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AlyrefO08583 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AlyrefO08583 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AlyrefO08583 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlyrefO08583 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlyrefO08583 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlyrefO08583 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlyrefO08583 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AlyrefO08583 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms