Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mesp2O08574 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mesp2O08574 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mesp2O08574 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mesp2O08574 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mesp2O08574 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mesp2O08574 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mesp2O08574 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mesp2O08574 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mesp2O08574 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mesp2O08574 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mesp2O08574 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mesp2O08574 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mesp2O08574 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mesp2O08574 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mesp2O08574 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mesp2O08574 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mesp2O08574 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mesp2O08574 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mesp2O08574 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mesp2O08574 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mesp2O08574 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mesp2O08574 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mesp2O08574 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mesp2O08574 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mesp2O08574 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mesp2O08574 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mesp2O08574 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mesp2O08574 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mesp2O08574 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mesp2O08574 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mesp2O08574 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mesp2O08574 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mesp2O08574 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mesp2O08574 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mesp2O08574 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mesp2O08574 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mesp2O08574 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mesp2O08574 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mesp2O08574 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mesp2O08574 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mesp2O08574 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms