Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna3O08545 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efna3O08545 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efna3O08545 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efna3O08545 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Efna3O08545 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efna3O08545 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efna3O08545 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efna3O08545 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Efna3O08545 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efna3O08545 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efna3O08545 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna3O08545 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna3O08545 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efna3O08545 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Efna3O08545 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efna3O08545 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Efna3O08545 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efna3O08545 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efna3O08545 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efna3O08545 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efna3O08545 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efna3O08545 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efna3O08545 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efna3O08545 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efna3O08545 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efna3O08545 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efna3O08545 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efna3O08545 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efna3O08545 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efna3O08545 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efna3O08545 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efna3O08545 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efna3O08545 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Efna3O08545 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efna3O08545 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efna3O08545 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efna3O08545 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efna3O08545 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Efna3O08545 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efna3O08545 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Efna3O08545 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Efna3O08545 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efna3O08545 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Efna3O08545 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efna3O08545 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efna3O08545 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Efna3O08545 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efna3O08545 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efna3O08545 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efna3O08545 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efna3O08545 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efna3O08545 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efna3O08545 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efna3O08545 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efna3O08545 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efna3O08545 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efna3O08545 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efna3O08545 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Efna3O08545 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Efna3O08545 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Efna3O08545 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efna3O08545 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna3O08545 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efna3O08545 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efna3O08545 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Efna3O08545 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Efna3O08545 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efna3O08545 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Efna3O08545 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Efna3O08545 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efna3O08545 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efna3O08545 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms