Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm379J3QQ19 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm379J3QQ19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm379J3QQ19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm379J3QQ19 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm379J3QQ19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm379J3QQ19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm379J3QQ19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm379J3QQ19 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm379J3QQ19 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm379J3QQ19 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm379J3QQ19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm379J3QQ19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm379J3QQ19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm379J3QQ19 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm379J3QQ19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm379J3QQ19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm379J3QQ19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm379J3QQ19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm379J3QQ19 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm379J3QQ19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm379J3QQ19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm379J3QQ19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm379J3QQ19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm379J3QQ19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm379J3QQ19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm379J3QQ19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm379J3QQ19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm379J3QQ19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm379J3QQ19 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm379J3QQ19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm379J3QQ19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm379J3QQ19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm379J3QQ19 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm379J3QQ19 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm379J3QQ19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm379J3QQ19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm379J3QQ19 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm379J3QQ19 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm379J3QQ19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm379J3QQ19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm379J3QQ19 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm379J3QQ19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm379J3QQ19 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm379J3QQ19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm379J3QQ19 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm379J3QQ19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm379J3QQ19 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm379J3QQ19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm379J3QQ19 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm379J3QQ19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm379J3QQ19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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