Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21798J3QNU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21798J3QNU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21798J3QNU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21798J3QNU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21798J3QNU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21798J3QNU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21798J3QNU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21798J3QNU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21798J3QNU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21798J3QNU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21798J3QNU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21798J3QNU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21798J3QNU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21798J3QNU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21798J3QNU5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21798J3QNU5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21798J3QNU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21798J3QNU5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21798J3QNU5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21798J3QNU5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21798J3QNU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21798J3QNU5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21798J3QNU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21798J3QNU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21798J3QNU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21798J3QNU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21798J3QNU5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm21798J3QNU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm21798J3QNU5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm21798J3QNU5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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