Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smim18J3QNP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim18J3QNP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim18J3QNP2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim18J3QNP2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smim18J3QNP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim18J3QNP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim18J3QNP2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim18J3QNP2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smim18J3QNP2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smim18J3QNP2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smim18J3QNP2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smim18J3QNP2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smim18J3QNP2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smim18J3QNP2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smim18J3QNP2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smim18J3QNP2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smim18J3QNP2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smim18J3QNP2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smim18J3QNP2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smim18J3QNP2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Smim18J3QNP2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smim18J3QNP2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smim18J3QNP2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smim18J3QNP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smim18J3QNP2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smim18J3QNP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smim18J3QNP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim18J3QNP2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim18J3QNP2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim18J3QNP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim18J3QNP2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smim18J3QNP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smim18J3QNP2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim18J3QNP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim18J3QNP2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim18J3QNP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim18J3QNP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim18J3QNP2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim18J3QNP2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim18J3QNP2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim18J3QNP2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim18J3QNP2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim18J3QNP2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim18J3QNP2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim18J3QNP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim18J3QNP2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim18J3QNP2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim18J3QNP2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim18J3QNP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim18J3QNP2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim18J3QNP2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim18J3QNP2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim18J3QNP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smim18J3QNP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smim18J3QNP2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smim18J3QNP2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim18J3QNP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim18J3QNP2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smim18J3QNP2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim18J3QNP2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim18J3QNP2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smim18J3QNP2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smim18J3QNP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim18J3QNP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms