Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a18J3QN01 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a18J3QN01 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a18J3QN01 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a18J3QN01 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a18J3QN01 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a18J3QN01 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a18J3QN01 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a18J3QN01 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a18J3QN01 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a18J3QN01 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a18J3QN01 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a18J3QN01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a18J3QN01 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a18J3QN01 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a18J3QN01 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a18J3QN01 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a18J3QN01 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ms4a18J3QN01 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ms4a18J3QN01 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ms4a18J3QN01 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ms4a18J3QN01 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ms4a18J3QN01 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ms4a18J3QN01 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ms4a18J3QN01 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a18J3QN01 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ms4a18J3QN01 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a18J3QN01 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ms4a18J3QN01 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a18J3QN01 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a18J3QN01 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a18J3QN01 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a18J3QN01 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a18J3QN01 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a18J3QN01 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a18J3QN01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a18J3QN01 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a18J3QN01 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a18J3QN01 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a18J3QN01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a18J3QN01 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a18J3QN01 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a18J3QN01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a18J3QN01 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a18J3QN01 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a18J3QN01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a18J3QN01 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a18J3QN01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a18J3QN01 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a18J3QN01 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a18J3QN01 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a18J3QN01 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a18J3QN01 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a18J3QN01 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a18J3QN01 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a18J3QN01 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a18J3QN01 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a18J3QN01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a18J3QN01 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a18J3QN01 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a18J3QN01 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a18J3QN01 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a18J3QN01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms