Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc179J3QM76 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc179J3QM76 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc179J3QM76 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc179J3QM76 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc179J3QM76 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc179J3QM76 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc179J3QM76 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc179J3QM76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc179J3QM76 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc179J3QM76 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc179J3QM76 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc179J3QM76 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc179J3QM76 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc179J3QM76 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc179J3QM76 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc179J3QM76 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc179J3QM76 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc179J3QM76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc179J3QM76 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc179J3QM76 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc179J3QM76 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc179J3QM76 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc179J3QM76 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc179J3QM76 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc179J3QM76 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms