Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r194J3JS27 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r194J3JS27 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r194J3JS27 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r194J3JS27 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r194J3JS27 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r194J3JS27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r194J3JS27 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r194J3JS27 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r194J3JS27 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r194J3JS27 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r194J3JS27 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r194J3JS27 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r194J3JS27 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r194J3JS27 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r194J3JS27 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r194J3JS27 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r194J3JS27 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r194J3JS27 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r194J3JS27 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r194J3JS27 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r194J3JS27 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r194J3JS27 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r194J3JS27 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r194J3JS27 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r194J3JS27 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r194J3JS27 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r194J3JS27 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r194J3JS27 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r194J3JS27 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r194J3JS27 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r194J3JS27 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r194J3JS27 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r194J3JS27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r194J3JS27 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r194J3JS27 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r194J3JS27 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r194J3JS27 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r194J3JS27 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r194J3JS27 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r194J3JS27 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r194J3JS27 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r194J3JS27 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r194J3JS27 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r194J3JS27 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r194J3JS27 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r194J3JS27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r194J3JS27 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r194J3JS27 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r194J3JS27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r194J3JS27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r194J3JS27 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r194J3JS27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r194J3JS27 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r194J3JS27 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r194J3JS27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r194J3JS27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r194J3JS27 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r194J3JS27 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vmn1r194J3JS27 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r194J3JS27 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r194J3JS27 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms