Protein–RNA interactions for Protein: G5E845

Kcnk16, MCG5959, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk16G5E845 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnk16G5E845 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnk16G5E845 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnk16G5E845 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnk16G5E845 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnk16G5E845 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnk16G5E845 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnk16G5E845 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcnk16G5E845 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnk16G5E845 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcnk16G5E845 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnk16G5E845 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnk16G5E845 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnk16G5E845 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcnk16G5E845 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnk16G5E845 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcnk16G5E845 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnk16G5E845 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnk16G5E845 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Kcnk16G5E845 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Kcnk16G5E845 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnk16G5E845 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcnk16G5E845 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcnk16G5E845 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnk16G5E845 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnk16G5E845 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kcnk16G5E845 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcnk16G5E845 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnk16G5E845 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnk16G5E845 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnk16G5E845 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnk16G5E845 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnk16G5E845 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnk16G5E845 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcnk16G5E845 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnk16G5E845 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnk16G5E845 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnk16G5E845 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnk16G5E845 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kcnk16G5E845 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kcnk16G5E845 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kcnk16G5E845 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnk16G5E845 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kcnk16G5E845 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kcnk16G5E845 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnk16G5E845 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnk16G5E845 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kcnk16G5E845 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcnk16G5E845 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnk16G5E845 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnk16G5E845 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kcnk16G5E845 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Kcnk16G5E845 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcnk16G5E845 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnk16G5E845 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnk16G5E845 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnk16G5E845 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnk16G5E845 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnk16G5E845 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnk16G5E845 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnk16G5E845 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnk16G5E845 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnk16G5E845 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Kcnk16G5E845 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnk16G5E845 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnk16G5E845 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnk16G5E845 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnk16G5E845 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnk16G5E845 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnk16G5E845 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnk16G5E845 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms