Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim15G3UY57 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim15G3UY57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim15G3UY57 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim15G3UY57 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim15G3UY57 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim15G3UY57 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim15G3UY57 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim15G3UY57 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim15G3UY57 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim15G3UY57 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim15G3UY57 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim15G3UY57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim15G3UY57 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim15G3UY57 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim15G3UY57 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim15G3UY57 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim15G3UY57 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim15G3UY57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim15G3UY57 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim15G3UY57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim15G3UY57 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim15G3UY57 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim15G3UY57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim15G3UY57 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim15G3UY57 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim15G3UY57 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim15G3UY57 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim15G3UY57 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim15G3UY57 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim15G3UY57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim15G3UY57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim15G3UY57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim15G3UY57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim15G3UY57 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim15G3UY57 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim15G3UY57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim15G3UY57 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim15G3UY57 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim15G3UY57 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim15G3UY57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim15G3UY57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim15G3UY57 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim15G3UY57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim15G3UY57 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim15G3UY57 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim15G3UY57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim15G3UY57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim15G3UY57 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim15G3UY57 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim15G3UY57 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim15G3UY57 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim15G3UY57 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim15G3UY57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim15G3UY57 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim15G3UY57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim15G3UY57 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim15G3UY57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim15G3UY57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim15G3UY57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim15G3UY57 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim15G3UY57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim15G3UY57 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim15G3UY57 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim15G3UY57 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim15G3UY57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim15G3UY57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim15G3UY57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim15G3UY57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim15G3UY57 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim15G3UY57 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim15G3UY57 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim15G3UY57 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim15G3UY57 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim15G3UY57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim15G3UY57 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim15G3UY57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim15G3UY57 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms