Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm17093F6XGJ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm17093F6XGJ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm17093F6XGJ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm17093F6XGJ4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm17093F6XGJ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm17093F6XGJ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm17093F6XGJ4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm17093F6XGJ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm17093F6XGJ4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm17093F6XGJ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm17093F6XGJ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm17093F6XGJ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm17093F6XGJ4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm17093F6XGJ4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm17093F6XGJ4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17093F6XGJ4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17093F6XGJ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm17093F6XGJ4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm17093F6XGJ4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm17093F6XGJ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm17093F6XGJ4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17093F6XGJ4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17093F6XGJ4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm17093F6XGJ4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm17093F6XGJ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm17093F6XGJ4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm17093F6XGJ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm17093F6XGJ4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17093F6XGJ4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm17093F6XGJ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm17093F6XGJ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm17093F6XGJ4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm17093F6XGJ4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm17093F6XGJ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm17093F6XGJ4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm17093F6XGJ4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm17093F6XGJ4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm17093F6XGJ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm17093F6XGJ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm17093F6XGJ4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm17093F6XGJ4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm17093F6XGJ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm17093F6XGJ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17093F6XGJ4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17093F6XGJ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17093F6XGJ4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm17093F6XGJ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm17093F6XGJ4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm17093F6XGJ4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm17093F6XGJ4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm17093F6XGJ4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm17093F6XGJ4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm17093F6XGJ4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm17093F6XGJ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm17093F6XGJ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm17093F6XGJ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm17093F6XGJ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm17093F6XGJ4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm17093F6XGJ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm17093F6XGJ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm17093F6XGJ4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm17093F6XGJ4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm17093F6XGJ4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm17093F6XGJ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm17093F6XGJ4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm17093F6XGJ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms