Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm17555F6U8B9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm17555F6U8B9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm17555F6U8B9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm17555F6U8B9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm17555F6U8B9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm17555F6U8B9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm17555F6U8B9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm17555F6U8B9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm17555F6U8B9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm17555F6U8B9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm17555F6U8B9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm17555F6U8B9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm17555F6U8B9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm17555F6U8B9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm17555F6U8B9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm17555F6U8B9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm17555F6U8B9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm17555F6U8B9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm17555F6U8B9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm17555F6U8B9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17555F6U8B9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm17555F6U8B9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm17555F6U8B9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm17555F6U8B9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm17555F6U8B9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm17555F6U8B9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm17555F6U8B9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm17555F6U8B9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm17555F6U8B9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm17555F6U8B9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm17555F6U8B9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm17555F6U8B9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm17555F6U8B9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm17555F6U8B9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm17555F6U8B9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm17555F6U8B9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm17555F6U8B9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm17555F6U8B9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm17555F6U8B9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm17555F6U8B9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm17555F6U8B9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm17555F6U8B9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm17555F6U8B9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm17555F6U8B9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm17555F6U8B9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm17555F6U8B9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm17555F6U8B9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm17555F6U8B9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm17555F6U8B9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm17555F6U8B9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm17555F6U8B9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm17555F6U8B9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm17555F6U8B9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm17555F6U8B9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17555F6U8B9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm17555F6U8B9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm17555F6U8B9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17555F6U8B9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm17555F6U8B9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm17555F6U8B9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm17555F6U8B9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm17555F6U8B9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms