Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm10477F6SW83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm10477F6SW83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm10477F6SW83 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10477F6SW83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10477F6SW83 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10477F6SW83 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm10477F6SW83 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm10477F6SW83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm10477F6SW83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm10477F6SW83 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm10477F6SW83 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm10477F6SW83 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10477F6SW83 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10477F6SW83 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm10477F6SW83 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10477F6SW83 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10477F6SW83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10477F6SW83 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm10477F6SW83 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10477F6SW83 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm10477F6SW83 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10477F6SW83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10477F6SW83 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10477F6SW83 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm10477F6SW83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm10477F6SW83 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm10477F6SW83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm10477F6SW83 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm10477F6SW83 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm10477F6SW83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10477F6SW83 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10477F6SW83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm10477F6SW83 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm10477F6SW83 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm10477F6SW83 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm10477F6SW83 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm10477F6SW83 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm10477F6SW83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm10477F6SW83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm10477F6SW83 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm10477F6SW83 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm10477F6SW83 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm10477F6SW83 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10477F6SW83 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10477F6SW83 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10477F6SW83 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm10477F6SW83 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm10477F6SW83 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10477F6SW83 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10477F6SW83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10477F6SW83 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10477F6SW83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10477F6SW83 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10477F6SW83 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10477F6SW83 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10477F6SW83 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm10477F6SW83 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10477F6SW83 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10477F6SW83 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10477F6SW83 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10477F6SW83 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10477F6SW83 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10477F6SW83 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10477F6SW83 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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