Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3072F6SKY8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3072F6SKY8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3072F6SKY8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3072F6SKY8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3072F6SKY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3072F6SKY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3072F6SKY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3072F6SKY8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3072F6SKY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3072F6SKY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3072F6SKY8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3072F6SKY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3072F6SKY8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3072F6SKY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3072F6SKY8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3072F6SKY8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3072F6SKY8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3072F6SKY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3072F6SKY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3072F6SKY8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3072F6SKY8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3072F6SKY8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3072F6SKY8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3072F6SKY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3072F6SKY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3072F6SKY8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3072F6SKY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3072F6SKY8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3072F6SKY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3072F6SKY8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3072F6SKY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm3072F6SKY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3072F6SKY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3072F6SKY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3072F6SKY8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3072F6SKY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3072F6SKY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms