Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Herc6F2Z461 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Herc6F2Z461 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Herc6F2Z461 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Herc6F2Z461 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Herc6F2Z461 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Herc6F2Z461 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Herc6F2Z461 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Herc6F2Z461 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc6F2Z461 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Herc6F2Z461 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Herc6F2Z461 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Herc6F2Z461 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Herc6F2Z461 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Herc6F2Z461 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc6F2Z461 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Herc6F2Z461 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Herc6F2Z461 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Herc6F2Z461 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Herc6F2Z461 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Herc6F2Z461 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc6F2Z461 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc6F2Z461 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc6F2Z461 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Herc6F2Z461 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Herc6F2Z461 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Herc6F2Z461 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Herc6F2Z461 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Herc6F2Z461 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Herc6F2Z461 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Herc6F2Z461 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Herc6F2Z461 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc6F2Z461 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc6F2Z461 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Herc6F2Z461 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Herc6F2Z461 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Herc6F2Z461 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Herc6F2Z461 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Herc6F2Z461 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Herc6F2Z461 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Herc6F2Z461 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc6F2Z461 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Herc6F2Z461 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Herc6F2Z461 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Herc6F2Z461 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Herc6F2Z461 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc6F2Z461 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Herc6F2Z461 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc6F2Z461 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc6F2Z461 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Herc6F2Z461 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Herc6F2Z461 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc6F2Z461 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Herc6F2Z461 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc6F2Z461 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc6F2Z461 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc6F2Z461 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc6F2Z461 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc6F2Z461 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Herc6F2Z461 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herc6F2Z461 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herc6F2Z461 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc6F2Z461 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc6F2Z461 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herc6F2Z461 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc6F2Z461 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc6F2Z461 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc6F2Z461 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc6F2Z461 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc6F2Z461 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc6F2Z461 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc6F2Z461 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc6F2Z461 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms