Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C2cd2E9Q3C1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C2cd2E9Q3C1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C2cd2E9Q3C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C2cd2E9Q3C1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C2cd2E9Q3C1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2cd2E9Q3C1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C2cd2E9Q3C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C2cd2E9Q3C1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C2cd2E9Q3C1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C2cd2E9Q3C1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C2cd2E9Q3C1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C2cd2E9Q3C1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2cd2E9Q3C1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C2cd2E9Q3C1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C2cd2E9Q3C1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C2cd2E9Q3C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C2cd2E9Q3C1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C2cd2E9Q3C1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C2cd2E9Q3C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C2cd2E9Q3C1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C2cd2E9Q3C1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C2cd2E9Q3C1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C2cd2E9Q3C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C2cd2E9Q3C1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C2cd2E9Q3C1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C2cd2E9Q3C1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C2cd2E9Q3C1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C2cd2E9Q3C1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C2cd2E9Q3C1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C2cd2E9Q3C1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C2cd2E9Q3C1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C2cd2E9Q3C1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C2cd2E9Q3C1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C2cd2E9Q3C1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C2cd2E9Q3C1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
C2cd2E9Q3C1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C2cd2E9Q3C1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C2cd2E9Q3C1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C2cd2E9Q3C1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C2cd2E9Q3C1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C2cd2E9Q3C1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C2cd2E9Q3C1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2cd2E9Q3C1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2cd2E9Q3C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C2cd2E9Q3C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C2cd2E9Q3C1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2cd2E9Q3C1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C2cd2E9Q3C1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C2cd2E9Q3C1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C2cd2E9Q3C1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C2cd2E9Q3C1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C2cd2E9Q3C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2cd2E9Q3C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2cd2E9Q3C1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2cd2E9Q3C1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2cd2E9Q3C1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2cd2E9Q3C1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2cd2E9Q3C1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
C2cd2E9Q3C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2cd2E9Q3C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2cd2E9Q3C1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms