Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zfp558E9Q1J0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp558E9Q1J0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp558E9Q1J0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp558E9Q1J0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp558E9Q1J0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp558E9Q1J0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp558E9Q1J0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp558E9Q1J0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp558E9Q1J0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp558E9Q1J0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp558E9Q1J0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp558E9Q1J0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfp558E9Q1J0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfp558E9Q1J0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp558E9Q1J0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp558E9Q1J0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp558E9Q1J0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp558E9Q1J0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp558E9Q1J0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp558E9Q1J0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp558E9Q1J0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp558E9Q1J0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfp558E9Q1J0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zfp558E9Q1J0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp558E9Q1J0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp558E9Q1J0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfp558E9Q1J0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp558E9Q1J0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Zfp558E9Q1J0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp558E9Q1J0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms