Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Triml2E9PW10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Triml2E9PW10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Triml2E9PW10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Triml2E9PW10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Triml2E9PW10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Triml2E9PW10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Triml2E9PW10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Triml2E9PW10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Triml2E9PW10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Triml2E9PW10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Triml2E9PW10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Triml2E9PW10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Triml2E9PW10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Triml2E9PW10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Triml2E9PW10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Triml2E9PW10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Triml2E9PW10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Triml2E9PW10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Triml2E9PW10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Triml2E9PW10 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Triml2E9PW10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Triml2E9PW10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Triml2E9PW10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Triml2E9PW10 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Triml2E9PW10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Triml2E9PW10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Triml2E9PW10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Triml2E9PW10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Triml2E9PW10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Triml2E9PW10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Triml2E9PW10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Triml2E9PW10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Triml2E9PW10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Triml2E9PW10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Triml2E9PW10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Triml2E9PW10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Triml2E9PW10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Triml2E9PW10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Triml2E9PW10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Triml2E9PW10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Triml2E9PW10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Triml2E9PW10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Triml2E9PW10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Triml2E9PW10 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Triml2E9PW10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Triml2E9PW10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Triml2E9PW10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Triml2E9PW10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Triml2E9PW10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Triml2E9PW10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Triml2E9PW10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Triml2E9PW10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Triml2E9PW10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Triml2E9PW10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Triml2E9PW10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Triml2E9PW10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Triml2E9PW10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Triml2E9PW10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Triml2E9PW10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Triml2E9PW10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Triml2E9PW10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Triml2E9PW10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Triml2E9PW10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Triml2E9PW10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Triml2E9PW10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Triml2E9PW10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Triml2E9PW10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Triml2E9PW10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Triml2E9PW10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Triml2E9PW10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Triml2E9PW10 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Triml2E9PW10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Triml2E9PW10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Triml2E9PW10 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Triml2E9PW10 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Triml2E9PW10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Triml2E9PW10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Triml2E9PW10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Triml2E9PW10 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Triml2E9PW10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Triml2E9PW10 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Triml2E9PW10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Triml2E9PW10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Triml2E9PW10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Triml2E9PW10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Triml2E9PW10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Triml2E9PW10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Triml2E9PW10 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Triml2E9PW10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Triml2E9PW10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Triml2E9PW10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Triml2E9PW10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Triml2E9PW10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms