Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Galntl6E5D8G1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Galntl6E5D8G1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Galntl6E5D8G1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Galntl6E5D8G1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Galntl6E5D8G1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Galntl6E5D8G1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Galntl6E5D8G1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Galntl6E5D8G1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Galntl6E5D8G1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Galntl6E5D8G1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Galntl6E5D8G1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Galntl6E5D8G1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Galntl6E5D8G1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Galntl6E5D8G1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Galntl6E5D8G1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Galntl6E5D8G1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Galntl6E5D8G1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Galntl6E5D8G1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Galntl6E5D8G1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Galntl6E5D8G1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Galntl6E5D8G1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Galntl6E5D8G1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Galntl6E5D8G1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Galntl6E5D8G1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Galntl6E5D8G1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Galntl6E5D8G1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Galntl6E5D8G1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Galntl6E5D8G1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Galntl6E5D8G1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Galntl6E5D8G1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Galntl6E5D8G1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Galntl6E5D8G1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Galntl6E5D8G1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Galntl6E5D8G1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Galntl6E5D8G1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Galntl6E5D8G1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Galntl6E5D8G1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Galntl6E5D8G1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Galntl6E5D8G1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Galntl6E5D8G1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Galntl6E5D8G1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Galntl6E5D8G1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Galntl6E5D8G1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Galntl6E5D8G1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Galntl6E5D8G1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Galntl6E5D8G1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Galntl6E5D8G1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Galntl6E5D8G1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Galntl6E5D8G1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Galntl6E5D8G1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Galntl6E5D8G1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Galntl6E5D8G1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Galntl6E5D8G1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Galntl6E5D8G1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Galntl6E5D8G1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Galntl6E5D8G1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Galntl6E5D8G1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Galntl6E5D8G1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Galntl6E5D8G1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Galntl6E5D8G1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Galntl6E5D8G1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Galntl6E5D8G1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Galntl6E5D8G1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Galntl6E5D8G1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms