Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vpreb3D3Z6J4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vpreb3D3Z6J4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vpreb3D3Z6J4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vpreb3D3Z6J4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vpreb3D3Z6J4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb3D3Z6J4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb3D3Z6J4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vpreb3D3Z6J4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vpreb3D3Z6J4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb3D3Z6J4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb3D3Z6J4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vpreb3D3Z6J4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vpreb3D3Z6J4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vpreb3D3Z6J4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vpreb3D3Z6J4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vpreb3D3Z6J4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vpreb3D3Z6J4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms