Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf217D3YYI7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf217D3YYI7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf217D3YYI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf217D3YYI7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf217D3YYI7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf217D3YYI7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf217D3YYI7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf217D3YYI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf217D3YYI7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf217D3YYI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf217D3YYI7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf217D3YYI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf217D3YYI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf217D3YYI7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf217D3YYI7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf217D3YYI7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf217D3YYI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf217D3YYI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf217D3YYI7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf217D3YYI7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf217D3YYI7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf217D3YYI7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf217D3YYI7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf217D3YYI7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf217D3YYI7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms