Protein–RNA interactions for Protein: D3YUG0

Samd13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd13D3YUG0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd13D3YUG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd13D3YUG0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd13D3YUG0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd13D3YUG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samd13D3YUG0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd13D3YUG0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samd13D3YUG0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd13D3YUG0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd13D3YUG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd13D3YUG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd13D3YUG0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd13D3YUG0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd13D3YUG0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd13D3YUG0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd13D3YUG0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd13D3YUG0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd13D3YUG0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd13D3YUG0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samd13D3YUG0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd13D3YUG0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd13D3YUG0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd13D3YUG0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms