Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zbed5B2RPU8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zbed5B2RPU8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zbed5B2RPU8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbed5B2RPU8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbed5B2RPU8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zbed5B2RPU8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zbed5B2RPU8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zbed5B2RPU8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zbed5B2RPU8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zbed5B2RPU8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zbed5B2RPU8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zbed5B2RPU8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zbed5B2RPU8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zbed5B2RPU8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zbed5B2RPU8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zbed5B2RPU8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zbed5B2RPU8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zbed5B2RPU8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zbed5B2RPU8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed5B2RPU8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed5B2RPU8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zbed5B2RPU8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zbed5B2RPU8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed5B2RPU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbed5B2RPU8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed5B2RPU8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed5B2RPU8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed5B2RPU8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed5B2RPU8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed5B2RPU8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed5B2RPU8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed5B2RPU8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbed5B2RPU8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbed5B2RPU8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbed5B2RPU8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbed5B2RPU8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbed5B2RPU8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbed5B2RPU8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zbed5B2RPU8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbed5B2RPU8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed5B2RPU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbed5B2RPU8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbed5B2RPU8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbed5B2RPU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zbed5B2RPU8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zbed5B2RPU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed5B2RPU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zbed5B2RPU8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zbed5B2RPU8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zbed5B2RPU8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zbed5B2RPU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed5B2RPU8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zbed5B2RPU8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed5B2RPU8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed5B2RPU8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed5B2RPU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbed5B2RPU8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed5B2RPU8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbed5B2RPU8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbed5B2RPU8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbed5B2RPU8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbed5B2RPU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed5B2RPU8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbed5B2RPU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed5B2RPU8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed5B2RPU8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed5B2RPU8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed5B2RPU8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed5B2RPU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed5B2RPU8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbed5B2RPU8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed5B2RPU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbed5B2RPU8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed5B2RPU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed5B2RPU8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbed5B2RPU8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed5B2RPU8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed5B2RPU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed5B2RPU8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed5B2RPU8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed5B2RPU8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed5B2RPU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed5B2RPU8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed5B2RPU8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms