Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xlr4aA2BI40 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xlr4aA2BI40 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xlr4aA2BI40 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xlr4aA2BI40 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xlr4aA2BI40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xlr4aA2BI40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xlr4aA2BI40 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xlr4aA2BI40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xlr4aA2BI40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xlr4aA2BI40 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xlr4aA2BI40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xlr4aA2BI40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xlr4aA2BI40 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xlr4aA2BI40 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xlr4aA2BI40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xlr4aA2BI40 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xlr4aA2BI40 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xlr4aA2BI40 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Xlr4aA2BI40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Xlr4aA2BI40 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Xlr4aA2BI40 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Xlr4aA2BI40 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Xlr4aA2BI40 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Xlr4aA2BI40 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xlr4aA2BI40 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Xlr4aA2BI40 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Xlr4aA2BI40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xlr4aA2BI40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Xlr4aA2BI40 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Xlr4aA2BI40 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Xlr4aA2BI40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xlr4aA2BI40 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xlr4aA2BI40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Xlr4aA2BI40 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Xlr4aA2BI40 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Xlr4aA2BI40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Xlr4aA2BI40 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xlr4aA2BI40 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Xlr4aA2BI40 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xlr4aA2BI40 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xlr4aA2BI40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xlr4aA2BI40 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xlr4aA2BI40 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xlr4aA2BI40 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xlr4aA2BI40 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xlr4aA2BI40 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xlr4aA2BI40 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xlr4aA2BI40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr4aA2BI40 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr4aA2BI40 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr4aA2BI40 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xlr4aA2BI40 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xlr4aA2BI40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xlr4aA2BI40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr4aA2BI40 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr4aA2BI40 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xlr4aA2BI40 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xlr4aA2BI40 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr4aA2BI40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr4aA2BI40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms