Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Itga8A2ARA8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itga8A2ARA8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga8A2ARA8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga8A2ARA8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga8A2ARA8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itga8A2ARA8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga8A2ARA8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itga8A2ARA8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Itga8A2ARA8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga8A2ARA8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga8A2ARA8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga8A2ARA8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itga8A2ARA8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga8A2ARA8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga8A2ARA8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itga8A2ARA8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga8A2ARA8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga8A2ARA8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga8A2ARA8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga8A2ARA8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Itga8A2ARA8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itga8A2ARA8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itga8A2ARA8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga8A2ARA8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga8A2ARA8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itga8A2ARA8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Itga8A2ARA8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga8A2ARA8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga8A2ARA8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga8A2ARA8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itga8A2ARA8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga8A2ARA8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itga8A2ARA8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itga8A2ARA8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga8A2ARA8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Itga8A2ARA8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Itga8A2ARA8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itga8A2ARA8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga8A2ARA8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itga8A2ARA8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itga8A2ARA8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga8A2ARA8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga8A2ARA8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga8A2ARA8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga8A2ARA8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itga8A2ARA8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itga8A2ARA8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga8A2ARA8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga8A2ARA8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itga8A2ARA8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga8A2ARA8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itga8A2ARA8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga8A2ARA8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga8A2ARA8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga8A2ARA8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga8A2ARA8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga8A2ARA8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga8A2ARA8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga8A2ARA8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga8A2ARA8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga8A2ARA8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga8A2ARA8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga8A2ARA8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Itga8A2ARA8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga8A2ARA8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga8A2ARA8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga8A2ARA8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga8A2ARA8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga8A2ARA8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga8A2ARA8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga8A2ARA8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itga8A2ARA8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga8A2ARA8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga8A2ARA8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga8A2ARA8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Itga8A2ARA8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms