Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtcflA2APF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtcflA2APF3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtcflA2APF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtcflA2APF3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtcflA2APF3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtcflA2APF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtcflA2APF3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtcflA2APF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtcflA2APF3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtcflA2APF3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtcflA2APF3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtcflA2APF3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtcflA2APF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtcflA2APF3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtcflA2APF3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtcflA2APF3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtcflA2APF3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtcflA2APF3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtcflA2APF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtcflA2APF3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtcflA2APF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtcflA2APF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtcflA2APF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtcflA2APF3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtcflA2APF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtcflA2APF3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtcflA2APF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtcflA2APF3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CtcflA2APF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcflA2APF3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcflA2APF3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtcflA2APF3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CtcflA2APF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtcflA2APF3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtcflA2APF3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcflA2APF3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcflA2APF3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcflA2APF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcflA2APF3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcflA2APF3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcflA2APF3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtcflA2APF3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtcflA2APF3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtcflA2APF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcflA2APF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtcflA2APF3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtcflA2APF3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CtcflA2APF3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtcflA2APF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtcflA2APF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtcflA2APF3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtcflA2APF3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtcflA2APF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtcflA2APF3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtcflA2APF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtcflA2APF3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CtcflA2APF3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtcflA2APF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtcflA2APF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CtcflA2APF3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtcflA2APF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtcflA2APF3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtcflA2APF3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtcflA2APF3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtcflA2APF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms