Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag3A2AIW0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdccag3A2AIW0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdccag3A2AIW0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdccag3A2AIW0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdccag3A2AIW0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdccag3A2AIW0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag3A2AIW0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sdccag3A2AIW0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sdccag3A2AIW0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sdccag3A2AIW0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sdccag3A2AIW0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sdccag3A2AIW0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdccag3A2AIW0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdccag3A2AIW0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdccag3A2AIW0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdccag3A2AIW0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdccag3A2AIW0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdccag3A2AIW0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdccag3A2AIW0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdccag3A2AIW0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdccag3A2AIW0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdccag3A2AIW0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdccag3A2AIW0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdccag3A2AIW0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdccag3A2AIW0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdccag3A2AIW0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdccag3A2AIW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdccag3A2AIW0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdccag3A2AIW0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdccag3A2AIW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdccag3A2AIW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdccag3A2AIW0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdccag3A2AIW0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdccag3A2AIW0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdccag3A2AIW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sdccag3A2AIW0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdccag3A2AIW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdccag3A2AIW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdccag3A2AIW0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdccag3A2AIW0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdccag3A2AIW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdccag3A2AIW0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sdccag3A2AIW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdccag3A2AIW0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdccag3A2AIW0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdccag3A2AIW0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdccag3A2AIW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdccag3A2AIW0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdccag3A2AIW0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdccag3A2AIW0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdccag3A2AIW0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdccag3A2AIW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdccag3A2AIW0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdccag3A2AIW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdccag3A2AIW0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdccag3A2AIW0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdccag3A2AIW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdccag3A2AIW0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdccag3A2AIW0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdccag3A2AIW0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdccag3A2AIW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdccag3A2AIW0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdccag3A2AIW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdccag3A2AIW0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdccag3A2AIW0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag3A2AIW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdccag3A2AIW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdccag3A2AIW0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdccag3A2AIW0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdccag3A2AIW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdccag3A2AIW0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdccag3A2AIW0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdccag3A2AIW0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 320.8 ms