Protein–RNA interactions for Protein: A2AFI6

Gm364, Transmembrane 9 superfamily member, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm364A2AFI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm364A2AFI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm364A2AFI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm364A2AFI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm364A2AFI6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm364A2AFI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm364A2AFI6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm364A2AFI6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm364A2AFI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm364A2AFI6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm364A2AFI6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm364A2AFI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm364A2AFI6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm364A2AFI6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm364A2AFI6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm364A2AFI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm364A2AFI6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm364A2AFI6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm364A2AFI6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm364A2AFI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm364A2AFI6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm364A2AFI6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm364A2AFI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm364A2AFI6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm364A2AFI6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm364A2AFI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm364A2AFI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm364A2AFI6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm364A2AFI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm364A2AFI6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm364A2AFI6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm364A2AFI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms