Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rasgef1aA0A0N4SVR5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rasgef1aA0A0N4SVR5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasgef1aA0A0N4SVR5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms