Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B230359F08RikA0A0B4J1K3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms