Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVR1

Ighv14-4, Immunoglobulin heavy variable 14-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv14-4A0A0A6YVR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighv14-4A0A0A6YVR1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv14-4A0A0A6YVR1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighv14-4A0A0A6YVR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv14-4A0A0A6YVR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms