Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r82A0A087WRV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r82A0A087WRV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r82A0A087WRV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r82A0A087WRV1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r82A0A087WRV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r82A0A087WRV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r82A0A087WRV1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r82A0A087WRV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r82A0A087WRV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r82A0A087WRV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r82A0A087WRV1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r82A0A087WRV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r82A0A087WRV1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r82A0A087WRV1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r82A0A087WRV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r82A0A087WRV1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r82A0A087WRV1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r82A0A087WRV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r82A0A087WRV1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r82A0A087WRV1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r82A0A087WRV1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r82A0A087WRV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r82A0A087WRV1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r82A0A087WRV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r82A0A087WRV1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r82A0A087WRV1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r82A0A087WRV1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r82A0A087WRV1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r82A0A087WRV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r82A0A087WRV1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r82A0A087WRV1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r82A0A087WRV1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r82A0A087WRV1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r82A0A087WRV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r82A0A087WRV1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r82A0A087WRV1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r82A0A087WRV1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r82A0A087WRV1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r82A0A087WRV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r82A0A087WRV1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r82A0A087WRV1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r82A0A087WRV1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r82A0A087WRV1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r82A0A087WRV1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r82A0A087WRV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r82A0A087WRV1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r82A0A087WRV1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r82A0A087WRV1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r82A0A087WRV1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r82A0A087WRV1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r82A0A087WRV1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r82A0A087WRV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r82A0A087WRV1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r82A0A087WRV1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r82A0A087WRV1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r82A0A087WRV1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r82A0A087WRV1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r82A0A087WRV1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r82A0A087WRV1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r82A0A087WRV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r82A0A087WRV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms