Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28360A0A087WR25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm28360A0A087WR25 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28360A0A087WR25 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28360A0A087WR25 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm28360A0A087WR25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Gm28360A0A087WR25 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gm28360A0A087WR25 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm28360A0A087WR25 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm28360A0A087WR25 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm28360A0A087WR25 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28360A0A087WR25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28360A0A087WR25 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28360A0A087WR25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28360A0A087WR25 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28360A0A087WR25 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28360A0A087WR25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28360A0A087WR25 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28360A0A087WR25 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm28360A0A087WR25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28360A0A087WR25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28360A0A087WR25 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28360A0A087WR25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28360A0A087WR25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28360A0A087WR25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm28360A0A087WR25 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28360A0A087WR25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28360A0A087WR25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28360A0A087WR25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28360A0A087WR25 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28360A0A087WR25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28360A0A087WR25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm28360A0A087WR25 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28360A0A087WR25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm28360A0A087WR25 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28360A0A087WR25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28360A0A087WR25 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm28360A0A087WR25 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm28360A0A087WR25 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28360A0A087WR25 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28360A0A087WR25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28360A0A087WR25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm28360A0A087WR25 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm28360A0A087WR25 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28360A0A087WR25 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28360A0A087WR25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28360A0A087WR25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28360A0A087WR25 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28360A0A087WR25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm28360A0A087WR25 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm28360A0A087WR25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28360A0A087WR25 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28360A0A087WR25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm28360A0A087WR25 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm28360A0A087WR25 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm28360A0A087WR25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm28360A0A087WR25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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