Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3238W4VSP7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3238W4VSP7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms