Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knop1Q9Z2Q2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms