Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shcbp1Q9Z179 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shcbp1Q9Z179 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shcbp1Q9Z179 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms