Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3bgrQ9WUZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.4 ms