Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stub1Q9WUD1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stub1Q9WUD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stub1Q9WUD1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stub1Q9WUD1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms