Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf13bQ9WU72 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf13bQ9WU72 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms