Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema6cQ9WTM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema6cQ9WTM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms